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Tutti gli alimenti sono contaminati da microrganismi in tutte le fasi dalla raccolta fino al raggiungimento del consumatore. Se il carico di microrganismi negli alimenti supera i limiti, la salute pubblica è in pericolo. Per questo motivo il carico di microrganismi negli alimenti è un parametro da controllare soprattutto in termini di sicurezza alimentare.
In generale, nella conta batterica aerobica; Vengono determinati i numeri batterici nei gruppi psicrofili, mesofili, termofili e le condizioni aerobiche / anaerobiche. L'analisi microbiologica più comunemente eseguita è il 'Total Mesophilic Aerobic Colony Count'. Con analisi come il conteggio dei batteri aerobici, possiamo avere un'idea della qualità del cibo consumato. Per questo motivo vengono effettuati processi di analisi come il conteggio delle colonie aerobiche al fine di avere informazioni su tutte le fasi che il cibo prodotto attraversa fino al consumo.
La conta totale dei microrganismi aerobici è accettata come uno dei parametri di qualità. Con il conteggio totale dei microrganismi aerobici, è possibile ottenere informazioni sulle condizioni di produzione, conservazione e trasporto degli alimenti, sull'uso di additivi e sulla durata di conservazione.